再出品の際に、発送元の地域を「東京都」と指定して、再出品しているためです。
意図せずに「東京都」となっている多くの場合は、再出品の際に「再出品共通設定ダイアログ」で設定する共通設定の、「新たに設定し直して再出品する」の「発送元の地域」が初期値の「東京都」のままになっているために起こります。
「発送元の地域」は「発送」タブページ内にあります。そのため、例えば、「新たに設定し直して再出品する」で再出品した場合で、かつ、「発送」タブページを一度も開かずに（設定を初期値から変更せずに）再出品すると、発送元の地域は、初期値の「東京都」になります。次の「発送元の地域の変更方法」を参照して、設定を確認・変更してください。
！「前回出品したときの設定を引き継いで再出品する」で再出品した場合は、発送元の地域が変更されることはありません。
発送元の地域の変更方法
再出品の際に発送元の地域を変更する場合は、再出品実行時に表示される「再出品共通設定ダイアログ」の「新たに設定し直して再出品する」の「発送」タブページにある「発送元の地域」で設定します。
！誤って「東京都」になってしまっているオークションの発送元の地域を変更したい場合は、「前回出品したときの設定を引き継いで再出品する」ではなく、「新たに設定し直して再出品する」で発送元の地域を設定し直して（「発送元の地域」を含め、共通設定をすべて設定し直して）、再出品する必要があります。